مثبت شدن ازمایش HLA-B27، در حضور علایم بالینی مانند درد مزمن، التهاب و بروز تغییرات دژنراتیو در استخوان ها، به نفع تشخیص بیماری های اسپوندیلیت، آرتریت واکنشی یا دیگر بیماری های اتوایمیون است، به ویژه اگر بیمار «مرد» باشد و بروز علایم پیش از 40 سالگی آغاز شده باشد. ممکن سات نتیجه تست HLA-B27 در درصدی از بیماران همواره منفی باشد، به همین دلیل منفی شدن نتیجه آزمایش HLA-B27 در بیماران نمی تواند تشخیص بیماری را به طور قطع رد کند. در حدود 90 درصد از مبتلایان به اسپوندیلیت، HLA-B27 مثبت هستند در حدود 80 درصد از مبتلایان به ارتریت روماتوئیدی نوجوانی HLA-B27 مثبت هستند در حدود 85-60 درصد از افراد مبتلا به آرتریت واکنشی، HLA-B27 مثبت هستند در حدود 70-40 درصد از مبتلایان به یووئیت قدامیف HLA-B27 مثبت هستند. وجود یا عدم وجود آنتی ژن های HLA به زنتیک فرد بستگی دارد و تولید این آنتی ژن ها توسط ژن هایی کنترل می گردد که از والدین به فرزندان منتقل شده اند. بنابراین مثبت بودن سابقه ی خانوادگی، خود می تواند یک فاکتور خطر ابتلا به بیماری به حساب آید