AMH در سندرم تخمدان پولی کیستیک (PCOS). افزایش می یابد. AMH در بعضی سرطان های تخمدان افزایش م یابد. کاهش AMH در دوره ی درمان تومورهای تخمدان که AMH تولید می کنند، نشان دهنده ی اثر بخشی درمان است. تست AMH در فرایند IVF کاربرد دارد. میزان AMH با احتمال موفقیت IVF ارتباط دارد. کاهش قابل ملاحظه در سطح AMH نشان دهنده شروع یائسگی است. سطح AMH در دختر بچه ها و پس از یائسگی پایین است. فقدان یا پاین بودن سطح AMH در پسر بچه ها ممکن است در اثر اختلال در ژن AMH باشد و معمولا در صورت عدم رد بیضه ها یا اختلال در عمکرد آن ها دیده می شود. فقدان ادروژن ها منجر به ناهنجاری دستگاه تناسلی و اندام های جنسی می شود. طبیعی بودن سطح AMH و آندروژن ها در پسر بچه هایی که بیضه ی آن ها پایین نیامده، به این معنی است که بیضه ها وجود دارند و فعالیت آن ها هم طبیعی است ولی از نظر فیزیکی در جایگاه طبیعی خود قرار نگرفته اند. AMH توسط فولیکول در حال رشد در تخمدان با سرعت ثابتی تولید می شود و مقدار آن تحت تاثیر قرص های ضد بارداری یا حاملگی قرار نمی گیرد.